胎儿超声检查头颅回声不均匀，考虑可能与胎儿畸形、病毒感染、钙化灶、脑积水等因素有关，需要根据不同病因选择具体的处理方式。

1、胎儿畸形：当胎儿存在脑部发育畸形时，可以导致胎儿头颅回声不均匀。如果不伴有其他脏器结构异常，一般建议在出生后进行手术治疗，如果存在心脏畸形，则通常需要终止妊娠;

2、病毒感染：如果孕妇存在病毒感染，病毒可以透过胎盘影响胎儿，从而导致胎儿发育异常，出现超声检查头颅回声不均匀的情况。这种情况下，孕妇需要注意做好孕期检查，必要时可以进行羊水穿刺或者脐血穿刺，排除胎儿染色体异常;

3、钙化灶：当胎儿出现钙化灶时，也可能出现超声检查头颅回声不均匀的情况。大部分属于生理现象，一般不影响胎儿的生长发育，建议产妇适当增加产检次数，按时产检;

4、脑积水：当胎儿出现脑积水时，由于脑室系统内的循环通道阻塞，可以导致颅内脑脊液量增多，此时进行超声检查，可以出现头颅回声不均匀的情况。当胎儿出现脑积水时，需要动态监测脑脊液分泌情况，如果胎儿脑积水没有好转，或者是脑积水加重，需要及时终止妊娠。

另外，超声检查可作为辅助检查，不能仅凭这一项检查结果来判断胎儿是否存在异常，建议同时抽血检查其它项目，如血常规、肝肾功能、病毒检查等。