囊肿是一种良性的病变，超声检查可以通过回声均匀、囊内呈均匀的高回声、边界清晰的特点，以及囊肿的大小、形态、位置等，来判断囊肿的性质。

1、回声均匀：超声检查时，如果囊肿呈单房性，或者多房性，通常为良性病变，因为单房性的囊肿和多房性的囊肿，多数情况下都为良性病变;

2、囊内呈均匀的高回声：常见为肝囊肿，如果囊内呈均匀的高回声，多考虑为良性的病变。此外，肾囊肿、卵巢囊肿等也可能会呈现出此类情况;

3、边界清晰：超声检查可以通过测量囊肿的边界，或根据囊肿与周围脏器的关系，判断囊肿是否存在边界清晰、形态不规则的特点，以帮助判断囊肿的性质;

4、囊肿大小：根据超声检查结果，判断囊肿是否存在大小不等的情况。如果囊肿较小，一般为小于5cm的情况，如果囊肿较大，可能会大于5cm。但是单纯性囊肿较小，并不一定是良性病变;

5、形态、位置：部分肾脏囊肿可见于肾盂积水，如果肾盂积水较明显，超声检查时可见肾盂扩张且不规则。此外，卵巢巧克力囊肿一般位置在右侧卵巢，可能表现为右侧卵巢出现比较大的巧克力囊肿。

除此之外，超声检查还可以观察到囊肿内是否有血流信号，以及与周围组织的关系。但超声检查存在一定局限性，不能明确囊肿的性质，需要结合临床表现以及其它检查进行综合判断。