超声气管镜检查有一定的痛苦，其相对于普通支气管镜检查较为困难，主要是因为支气管镜检查属于有创检查，在检查过程中患者可出现咳嗽、胸闷、呼吸困难等不适感。

1、咳嗽：在进行超声气管镜检查时，可刺激患者咽喉部出现咳嗽，但通常咳嗽较为剧烈，尤其是局麻下进行超声支气管镜检查时，患者可能会出现憋气、面色潮红等表现;

2、胸闷：患者在进行超声气管镜检查时，可能会因为支气管镜进入支气管内，对支气管造成刺激而出现胸闷的症状。但大多数患者可以忍受，如果对疼痛较为敏感，可选择在检查前注射麻醉药物后再进行检查;

3、呼吸困难：部分患者在进行超声气管镜检查时，可能会出现较为严重的呼吸困难表现，甚至需要张口呼吸，需在麻醉起效后再进行检查，以免出现缺氧的情况;

4、其他：由于超声气管镜检查属于有创检查，在检查过程中支气管镜会刺激患者呼吸道黏膜，导致患者出现咳痰、咯血等症状。

此外，部分患者在进行超声气管镜检查时，还可能因为技术不佳或操作不当，造成气胸、血胸等问题，需要通过胸腔闭式引流的方式进行治疗。总体来说，超声气管镜检查相对比较痛苦，医生会根据具体情况选择合适的方式缓解患者痛苦。

患者在进行超声气管镜检查前应禁食、禁水，检查后应多饮水促进排尿，积极配合医生进行治疗。